特別獎學金計劃目的是支持和鼓勵成績優異的學生繼續在一個較佳的學習環境下接受高等教育，為社會發展培養所需的人才。獎學金主要申請對象為就讀世界排名100位以內的大學，在該等大學升讀任一學科領域內的課程，或在各學科領域的世界大學排名中列前50位的大學的本澳永久性居民（大學排名參考《英國泰吾士報高等教育特刊》https://www.timeshighereducation.com/world-university-rankings/2016/world-ranking#!/page/0/length/25/name/chinese/sort_by/rank_label/sort_order/asc/cols/rank_only）。如申請人於2016/2017學年升讀非指定高等院校之全日制學士學位專業課程，該專業課程在其他具公信力之世界大學專業排名中名列前10位，亦可提出申請，但須經澳門基金會審核接受有關申請資格。55個獎學金名額根據大學所在地區分為亞洲、大洋洲、歐洲及美洲或其他地區四個區域，獲選學生將按其就讀地區獲定額獎學金，並須在完成課程後返回澳門或於內地服務，服務期間不少於受資助年期。獎學金獲得者可根據澳門基金會特別獎學金章程的續期條件申請續期，但以最短修讀年期為限。
特別獎學金之甄選方式將分為應屆中學/預科畢業生以及正就讀高等教育課程兩組作甄選，甄選評審以大學排名（30%）、學業成績（60%）及其他課外活動（10%）表現比率評分，綜合評分較高者獲優先考慮。
申請人應遞交文件包括：申請表正本、身份證影印本、錄取通知書或註冊證明書（如申請時尚未收到學校的錄取通知書或註冊證明書,可遞交證明已向學校申請就讀之文件，如入學申請書等）、畢業證書、成績表（應屆中學或預科畢業生申請人遞交畢業平均成績，英國地區申請人遞交GCE A-LEVEL成績；正在就讀高等教育課程申請人遞交已完成課程的累計成績）、課程簡介等文件。申請人應於7月29日或之前登入澳門基金會“特別獎學金”網上報名系統填寫報名資料，填寫後列印表格文本，連同所需報名文件以郵遞或親臨方式遞交至澳門基金會（英國地區申請人須於8月22日或之前補交GCE A-LEVEL成績考核的最後成績），申請人需提供文件正本供澳門基金會核對。
另由2016/2017學年起，所有領取澳門基金會特別獎學金金額將有所調升，中國內地每人每年澳門幣80,000元、亞洲其他地區每人每年澳門幣140,000元、大洋洲、歐洲及美洲地區每人每年澳門幣320,000元。
澳門基金會特別獎學金源於澳門基金會與教育暨青年局於2006年合作設立的特別獎學金計劃。由2012年開始，澳門基金會獨立執行特別獎學金計劃，全面負責相關申請及跟進工作，並在計劃執行過程中與教育暨青年局保持密切的溝通合作，使此項工作不斷完善，造福澳門學子。至今，已經有330名澳門學生獲得特別獎學金。此外，為保持原計劃的延續性，已收取特別獎學金且繼續在讀之學生，原有之獎學金發放模式不變。
2016/2017學年澳門基金會特別獎學金申請表格及章程可於澳門基金會（地址：澳門新馬路61-75號永光廣場7樓）索取或於澳門基金會網頁下載（網址： / 電郵：db_info@fm.org.mo），查詢電話 87950920 或 87950913。
